Благодарение на договор БеРТИСС/НИС-3249 с ръководител доц. Гергана Герова беше добавен нов 24-ядрен изчислителен възел cn027 който притежава следните технически характериситики:
- 2 бр. 64-битови 12-ядрени процесори Intel Xeon® E5-2650v4
- 94 GiB споделена оперативна памет
- 500 GB SATA3 твърд диск за съхранение на временни файлове
- InfiniBand контролер с пропускателна способност 56 Gbps
Машината работи с по-нова версия на операционната система Ubuntu Server 16.04 LTS
поради което част от софтуера не е съвместим. Възелът е добавен към следните опашки:
b_short.q
– серийни задачи до 4 hb_med.q
– серийни задачи до 48 hp_short.q
– паралелни задачи до 4 hp_med.q
– паралелни задачи до 48 h
Стартирането на задачи върху възел cn027 изисква да се укаже явно параметъра -l is_avx2 в противен случай задачата няма да бъде разпределена върху машината. В случай на паралелени задачи към възела са асоциирани следните две паралелните среди:
- threads – паралелни задачи със споделена памет до 24 нишки
- ompix24 – MPI задачи с брой на процесите до 24
Списък със съвместимият софтуер достъпен на новият изчислителен възел cn027:
Серийни компилатори и библиотеки
icc/13.1.003
ifort/13.1.003
mkl/13.1.003
gcc/4.8.1
icc/13.1.003
ifort/13.1.003
mkl/13.1.003
gcc/4.8.1
Паралалени компилатори
openmpi/1.6.5-intel-13.1
openmpi/1.8.3-intel-13.1
openmpi/1.6.5-intel-13.1
openmpi/1.8.3-intel-13.1
Научен софтуер
gaussian/g09
wrf/3.7.1
espresso/5.3.0-mkl-13.1-fftw
gromacs/4.6.5-mkl-13.1
gromacs/4.6.7-mkl-13.1
qmcpack/6406-mkl-13.1-fftw
siesta/3.1-openmpi-1.6.5-mkl
cp2k/2.4.0-openmpi-1.6.5-mkl
cp2k/3.0-openmpi-1.8.3-intel-13.1
cpmd/3.5.13-openmpi-1.6.5-mkl
elk/3.3.17-mkl-13.1-ompi-1.6.5
gaussian/g09
wrf/3.7.1
espresso/5.3.0-mkl-13.1-fftw
gromacs/4.6.5-mkl-13.1
gromacs/4.6.7-mkl-13.1
qmcpack/6406-mkl-13.1-fftw
siesta/3.1-openmpi-1.6.5-mkl
cp2k/2.4.0-openmpi-1.6.5-mkl
cp2k/3.0-openmpi-1.8.3-intel-13.1
cpmd/3.5.13-openmpi-1.6.5-mkl
elk/3.3.17-mkl-13.1-ompi-1.6.5
Други
python/2.7.13
mathematica/9.0
python/2.7.13
mathematica/9.0